Aktem prawnym, regulującym sposób załatwiania spraw jest ustawa z dnia 14 czerwca 1960 r. - Kodeks postępowania administracyjnego. Na podstawie zapisów ww. dokumentu urząd zobowiązany jest do załatwienia sprawy bez zbędnej zwłoki, nie później niż w ciągu miesiąca od dnia złożenia wniosku, a w sprawach wyjątkowo skomplikowanych, w ciągu dwóch miesięcy. Niekiedy terminy te, mogą zostać przekroczone, szczególnie gdy opóźnienie wynika z przyczyn niezależnych od urzędu. W takim przypadku konieczne jest poinformowanie zainteresowanego, z podaniem przyczyn zwłoki i wskazaniem nowego terminu załatwienia sprawy.

Wszystkie sprawy zgłaszane do urzędu załatwiane są przez wydziały merytoryczne. Pisma wpływające rejestrowane są w kancelarii ogólnej, a z obowiązku tego wykluczone są jedynie różnego rodzaju oferty, foldery reklamowe itp.

Procedury załatwiania spraw, opisano w kartach, uporządkowanych tematycznie. Zawierają one w szczególności informacje na temat dokumentów wymaganych dla załatwienia danej sprawy, opłat, miejsca złożenia i odbioru dokumentów, terminu udzielenia odpowiedzi oraz podstawy prawnej. Do kart załączono również pliki zawierające ww. dokumenty (wymagane dla załatwienia danej sprawy), które należy wydrukować, wypełnić i złożyć.

Sprawy z zakresu ocen oddziaływania na środowisko, m.in. uzgodnienie projektu studium uwarunkowań i kierunków zagospodarowania przestrzennego oraz miejscowych planów zagospodarowania przestrzennego, ponowne przeprowadzenie oceny oddziaływania, itp.

• Wniosek o opinię, co do konieczności przeprowadzenia strategicznej oceny oddziaływania na środowisko
• Wniosek o wydanie decyzji o środowiskowych uwarunkowaniach
• Wniosek o uzgodnienie zakresu i stopnia szczegółowości informacji wymaganych w prognozie oddziaływania na środowisko projektów dokumentów
• Wniosek o opinię dla projektów dokumentów , o których mowa w art. 46 i 47 ustawy o udostępnianiu informacji o środowisku i jego ochronie (...)
• Wniosek w sprawie uzgodnienia warunków realizacji przedsięwzięcia w ramach ponownej oceny oddziaływania na środowisko 
• Wniosek o uzgodnienie odstąpienia od przeprowadzenia strategicznej oceny oddziaływania na środowisko
• Wniosek w sprawie uzgodnienia warunków realizacji przedsięwzięcia
• Wniosek o opinię w sprawie obowiązku przeprowadzenia oceny oddziaływania na środowisko

Sprawy dotyczące ochrony przyrody, m.in.: wniosek o odstępstwa od zakazów w stosunku do chronionych gatunków roślin, grzybów i zwierząt, uzgodnienie zezwolenia na usunięcie drzew w obrębie pasa drogowego drogi publicznej, zezwolenie na wykonanie czynności podlegających zakazom  w stosunku do gatunków objętych ochroną, zezwolenie na czynności podlegające ograniczeniom w strefach ochrony ostoi, miejsc rozrodu i regularnego przebywania zwierząt objętych ochroną gatunkową, zaświadczeń dotyczących zalesienia gruntów

• Stwierdzenie obowiązku lub braku obowiązku przeprowadzenia oceny oddziaływania na obszar Natura 2000
• Szacowanie szkód wyrządzonych przez zwierzęta objęte ochroną gatunkową - bobry
• Szacowane szkód wyrządzonych przez zwierzęta objęte ochroną - wilki
• Szacowane szkód wyrządzonych przez zwierzęta objęte ochroną - żubry
• Wniosek o wydanie zezwolenia na odstępstwa od zakazów w stosunku do gatunków dziko występujących zwierząt, roślin lub grzybów objętych ochroną
• Wniosek o wydanie zezwolenia na odstępstwa od zakazów w stosunku do innych niż dziko występujących gatunków zwierząt, roślin lub grzybów objętych ochroną
• Wniosek o ustalenie strefy ochrony ostoi, miejsc rozrodu i regularnego przebywania zwierząt objętych ochrona gatunkową 
• Wniosek o wydanie zezwolenia na czynności polegające ograniczeniom w strefach ochrony miejsc rozrodu regularnego przebywania zwierząt objętych ochroną gatunkową
• Wniosek o uzgodnienie projektu uchwały sejmiku województwa w sprawie utworzenia / powiększenia obszaru parku krajobrazowego
• Wniosek o wydanie zaświadczenia o spełnieniu wymagań przez eksperta przyrodniczego o specjalności: ornitolog/botanik
• Uzgodnienie warunków realizacji przedsięwzięcia w wyniku oceny oddziaływania na obszar Natura 2000.
• Uzgodnienie projektu uchwały sejmiku województwa w sprawie likwidacji / zmniejszenia obszaru parku krajobrazowego
• Uzgodnienie projektu uchwały rady gminy w sprawie ustanowienia / zniesienia stanowiska dokumentacyjnego
• Uzgodnienie projektu uchwały sejmiku województwa w sprawie likwidacji / zmiany granic obszaru chronionego krajobrazu
• Uzgodnienie projektu uchwały sejmiku województwa w sprawie ustanowienia planu ochrony dla parku krajobrazowego
• Uzgodnienie projektu uchwały rady gminy w sprawie ustanowienia / zniesienia użytku ekologicznego
• Uzgodnienie projektu uchwały rady gminy w sprawie ustanowienia / zniesienia pomnika przyrody
• Zasady postępowania dotyczące przypadkowego schwytania lub zabicia zwierzęcia należącego do gatunku objętego ochroną wilka, rysia, niedźwiedzia, żubra, foki i morświna
• Zaświadczenie organu odpowiedzialnego za monitorowanie obszarów Natura 2000
• Zezwolenie na odstępstwo od zakazów w rezerwacie przyrody
• Zezwolenie regionalnego dyrektora ochrony środowiska na odstępstwa od zakazów w stosunku do zwierząt gatunków niebezpiecznych dla zdrowia i życia ludzi

Sprawy dotyczące zapobieganiu szkodom w środowisku i ich naprawie, m.in. uzgodnienie warunków rekultywacji zanieczyszczonej ziemi, przeprowadzenia działań naprawczych, zgłoszenie szkody w środowisku

• Zgłoszenie o wystąpieniu bezpośredniego zagrożenia szkodą w środowisku lub szkody w środowisku
• Zgłoszenie historycznego zanieczyszczenia powierzchni ziemi
• Uzgodnienie warunków rekultywacji zanieczyszczonej gleby lub ziemi.
• Wniosek o uzgodnienie warunków przeprowadzenia działań naprawczych w odniesieniu do szkód w gatunkach chronionych lub chronionych siedliskach przyrodniczych lub w wodach
• Wniosek o uzgodnienie warunków przeprowadzenia działań naprawczych w odniesieniu do szkody w powierzchni ziemi
• Wniosek o ustalenie planu remediacji historycznego zanieczyszczenia powierzchni ziemi

Sprawy związane z wydawaniem pozwoleń i zezwoleń na terenach zamkniętych

• Pozwolenie na wytwarzanie odpadów
• Pozwolenie na wprowadzanie gazów lub pyłów do powietrza
• Zezwolenie na prowadzenie działalności w zakresie przetwarzania odpadów
• Zezwolenie na zbieranie odpadów
• Zgłoszenie instalacji, których eksploatacja nie wymaga pozwolenia na wprowadzanie gazów lub pyłów do powietrza

Sprawy z zakresu dostępu do informacji

• Wniosek o udostępnienie informacji o środowisku i jego ochronie
• Wniosek o udostępnienie informacji publicznej